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昨天,记者从中国科学院海洋研究所了解到,该所科学家通力合作主导完成了仿刺参(俗称海参)的全基因组精细参考图谱绘制。该图谱揭示了海参的特殊形态进化与强大再生潜能天赋的由来。该研究成果不仅可助力我国刺参产业发展,还能为生物制药提供技术支持。 海参具有独特进化地位 。
昨天,国际学术期刊PLoS Biolo-gy在线刊发了由中科院海洋所杨红生研究员课题组和相建海、李富花研究员课题组主导,天津生物芯片技术公司、加拿大纽芬兰纪念大学等单位合作,由张晓军、孙丽娜、袁剑波等青年科研人员为共同第一作者,协力完成的研究论文,该研究首次完成了仿刺参Apostichopus japonicus (俗称海参)的全基因组精细参考图谱的绘制,揭示了海参的特殊形态进化与强大再生潜能的分子基础。
杨红生研究员告诉记者,海参属于棘皮动物,是其中体型与形态最为特殊的种类,且处于从无脊椎向脊椎动物分化的独特进化地位,也是国内外重要的海产经济物种,具有极高的营养与医用价值。在该研究中,研究人员利用采用新一代测序技术获得的刺参基因组数据优于多数水产动物基因组图谱的指标,构建了海参全基因组的精细图谱,编码30350个基因。
记者了解到,早在上世纪50年代,中科院海洋所科研人员就开展了海参的形态分类和经典生物学研究,查清了我国海参的分布和生物多样性特征,阐明了其分类学地位。十多年来,杨红生研究员等针对刺参的基础生物学、生态学和遗传育种应用开展了锲而不舍的系统研究。在理解刺参夏眠、再生和行为学上获得若干新认知,构建了刺参的遗传育种群体,培育了具有耐温高产、多刺和不同体色等性状的刺参新品系,并进行了示范应用和推广。 发现超强再生能力基因
研究人员分析发现了调控动物关键进化过程中脊索形成的关键转录因子Brachyury基因的FGF基因在棘皮动物中显著收缩为1个,提示了棘皮动物在长期的进化过程中脊索、咽鳃裂消失的潜在原因。海参的近亲——海胆具有显著、发达的外骨骼,而海参外表柔软,骨骼退化为细小的桌形体,基因组解析发现它们都具有相对完整的骨骼发育通路,而不同之处在于海胆的矿化基因为31个,海参缩减为7个,而且海参矿化基因在发育过程中低表达,这才是其骨骼显著退化的根本原因。
强大的再生潜能是棘皮动物最显著的特征之一,该研究利用多组学方法揭示了海参超强再生能力的分子机制。该种海参在强烈环境胁迫下可以将体内内脏几乎全部排出体外,当环境适宜后,可在2-3周重新长出功能完善的内脏器官。研究揭示了海参再生特有的由11个基因串联重复组成的PSP94-like基因簇和显著扩张成簇的FREP基因是海参具有超强再生能力的根本原因之一。